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对于房地产企业土地增值税清算时的开发费用，应按实际取得土地使用权支付的金额和开发成本的10%以内计算扣除。即，土地使用权的实际支付款金额加上开发成本的总额，乘以10%，以计算出扣除金额，因此实际上不是直接按10%扣除，而是在10%以内实际据实扣除。 此外，除了开发费用之外，还有部分清算不能扣除的费支出。例如，除土地使用权支付的金额和开发成本外，土地清理费、拆迁费、土地征收补偿费等也不能扣除。此外，在取得土地使用权支付的金额中，也不能扣除礼金、馈赠等费用。