企业合并时，股东取得股权的计税基础如何确定？

在企业合并的情况下，股东取得新公司股权的计税基础确定是一个比较复杂的问题，需要根据具体的合并形式（如吸收合并、新设合并等）以及相关税收政策来具体分析。通常情况下，税务机关会依据《中华人民共和国企业所得税法》及其实施条例等相关法律法规的规定来进行判定。
1. 一般性税务处理：如果企业合并不符合特殊性税务处理条件，则按照一般性税务处理原则进行。此时，股东取得的新公司股权的计税基础，应等于其转让原持有股权所获得的价值（包括但不限于货币、存货、固定资产等非现金对价）加上相关税费减去被投资单位已宣告但尚未发放的股息或利润分配。
2. 特殊性税务处理：当企业合并满足一定条件时，可以申请适用特殊性税务处理。这些条件通常涉及股权支付比例、控制权变化等多个方面。在符合特殊性税务处理的情况下，股东取得的新公司股权计税基础可按以下原则确定：
   - 股东以持有的原公司股权换取新公司股权的，其取得的新公司股权计税基础可以是原持有股权的计税基础。
   - 如果合并过程中涉及非股权支付（如现金、存货等），则对于这部分非股权支付对应的股权部分，需要按照公允价值确定计税基础，并可能产生相应的所得税义务。

3. 特殊情况：在某些特殊情况下，比如企业重组中涉及到的资产或负债转移、债务重组等，股东取得新公司股权的计税基础还可能受到其他因素的影响，具体应根据实际情况及税务机关的具体规定来确定。

总之，在处理企业合并过程中股东取得的新公司股权的计税基础问题时，应当综合考虑相关法律法规的规定，并结合企业的具体情况做出合理判断。在必要时，建议咨询专业的会计师或税务顾问以获得更准确的指导和帮助。